Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem35bQ3U0Y2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms