Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc9Q3U0M1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc9Q3U0M1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms