Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hbq1bQ3U0A6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hbq1bQ3U0A6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hbq1bQ3U0A6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hbq1bQ3U0A6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hbq1bQ3U0A6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hbq1bQ3U0A6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hbq1bQ3U0A6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hbq1bQ3U0A6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hbq1bQ3U0A6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hbq1bQ3U0A6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hbq1bQ3U0A6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hbq1bQ3U0A6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hbq1bQ3U0A6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hbq1bQ3U0A6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hbq1bQ3U0A6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms