Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem88bQ3TYP4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms