Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
InipQ3TXT3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
InipQ3TXT3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
InipQ3TXT3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
InipQ3TXT3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
InipQ3TXT3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
InipQ3TXT3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
InipQ3TXT3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
InipQ3TXT3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
InipQ3TXT3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms