Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccndbp1Q3TVC7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccndbp1Q3TVC7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
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