Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3TTL0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3TTL0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3TTL0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Q3TTL0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q3TTL0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Q3TTL0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q3TTL0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q3TTL0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q3TTL0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q3TTL0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q3TTL0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q3TTL0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q3TTL0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q3TTL0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q3TTL0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q3TTL0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms