Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM8

Hk3, Hexokinase-3, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hk3Q3TRM8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hk3Q3TRM8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hk3Q3TRM8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hk3Q3TRM8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hk3Q3TRM8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hk3Q3TRM8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hk3Q3TRM8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hk3Q3TRM8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hk3Q3TRM8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hk3Q3TRM8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hk3Q3TRM8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hk3Q3TRM8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hk3Q3TRM8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hk3Q3TRM8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hk3Q3TRM8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hk3Q3TRM8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hk3Q3TRM8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hk3Q3TRM8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hk3Q3TRM8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hk3Q3TRM8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hk3Q3TRM8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms