Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp39Q3TIX9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 470.7 ms