Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnnm3Q32NY4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnnm3Q32NY4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnnm3Q32NY4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms