Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam178bQ24JP3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fam178bQ24JP3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam178bQ24JP3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam178bQ24JP3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam178bQ24JP3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam178bQ24JP3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam178bQ24JP3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam178bQ24JP3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam178bQ24JP3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam178bQ24JP3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam178bQ24JP3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam178bQ24JP3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam178bQ24JP3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam178bQ24JP3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
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