Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpne9Q1RLL3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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