Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd300lgQ1ERP8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd300lgQ1ERP8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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