Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cers3Q1A3B0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cers3Q1A3B0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cers3Q1A3B0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
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