Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpusd2Q149F1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpusd2Q149F1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
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