Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VgfQ0VGU4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VgfQ0VGU4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms