Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc162pQ0VG85 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc162pQ0VG85 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms