Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Itgb8Q0VBD0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb8Q0VBD0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms