Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc45a4Q0P5V9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc45a4Q0P5V9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms