Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cib3Q0P523 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib3Q0P523 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms