Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cnnm1Q0GA42 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cnnm1Q0GA42 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cnnm1Q0GA42 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cnnm1Q0GA42 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cnnm1Q0GA42 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cnnm1Q0GA42 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cnnm1Q0GA42 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cnnm1Q0GA42 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cnnm1Q0GA42 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cnnm1Q0GA42 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cnnm1Q0GA42 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cnnm1Q0GA42 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cnnm1Q0GA42 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cnnm1Q0GA42 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cnnm1Q0GA42 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cnnm1Q0GA42 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cnnm1Q0GA42 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cnnm1Q0GA42 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cnnm1Q0GA42 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cnnm1Q0GA42 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cnnm1Q0GA42 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms