Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc7a1Q09143 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc7a1Q09143 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc7a1Q09143 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc7a1Q09143 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc7a1Q09143 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc7a1Q09143 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc7a1Q09143 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc7a1Q09143 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc7a1Q09143 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc7a1Q09143 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc7a1Q09143 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms