Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxc4Q08624 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc4Q08624 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc4Q08624 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms