Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Calb2Q08331 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Calb2Q08331 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Calb2Q08331 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Calb2Q08331 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calb2Q08331 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calb2Q08331 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calb2Q08331 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Calb2Q08331 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calb2Q08331 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calb2Q08331 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calb2Q08331 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calb2Q08331 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calb2Q08331 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calb2Q08331 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Calb2Q08331 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calb2Q08331 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calb2Q08331 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calb2Q08331 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calb2Q08331 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Calb2Q08331 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Calb2Q08331 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Calb2Q08331 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calb2Q08331 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calb2Q08331 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Calb2Q08331 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Calb2Q08331 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calb2Q08331 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calb2Q08331 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Calb2Q08331 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Calb2Q08331 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calb2Q08331 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calb2Q08331 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calb2Q08331 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Calb2Q08331 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Calb2Q08331 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calb2Q08331 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Calb2Q08331 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calb2Q08331 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms