Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfe2Q07279 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfe2Q07279 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfe2Q07279 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfe2Q07279 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nfe2Q07279 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nfe2Q07279 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nfe2Q07279 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nfe2Q07279 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms