Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs3Q05895 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms