Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col9a1Q05722 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col9a1Q05722 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col9a1Q05722 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms