Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoc2Q05020 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms