Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk18Q04899 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk18Q04899 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk18Q04899 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk18Q04899 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk18Q04899 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk18Q04899 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk18Q04899 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk18Q04899 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk18Q04899 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk18Q04899 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk18Q04899 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk18Q04899 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk18Q04899 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms