Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox13Q04891 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox13Q04891 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox13Q04891 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sox13Q04891 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sox13Q04891 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox13Q04891 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox13Q04891 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox13Q04891 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox13Q04891 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox13Q04891 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox13Q04891 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox13Q04891 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox13Q04891 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox13Q04891 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox13Q04891 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox13Q04891 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox13Q04891 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox13Q04891 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox13Q04891 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox13Q04891 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox13Q04891 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox13Q04891 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox13Q04891 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox13Q04891 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms