Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarcad1Q04692 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcad1Q04692 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms