Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpd1Q04519 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd1Q04519 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smpd1Q04519 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms