Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RelaQ04207 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RelaQ04207 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RelaQ04207 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RelaQ04207 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RelaQ04207 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RelaQ04207 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RelaQ04207 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RelaQ04207 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RelaQ04207 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RelaQ04207 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RelaQ04207 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RelaQ04207 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RelaQ04207 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RelaQ04207 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RelaQ04207 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms