Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Msx2Q03358 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms