Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms