Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GscQ02591 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GscQ02591 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GscQ02591 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GscQ02591 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GscQ02591 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GscQ02591 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GscQ02591 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GscQ02591 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GscQ02591 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GscQ02591 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GscQ02591 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GscQ02591 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GscQ02591 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GscQ02591 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GscQ02591 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GscQ02591 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GscQ02591 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GscQ02591 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GscQ02591 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GscQ02591 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GscQ02591 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GscQ02591 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GscQ02591 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GscQ02591 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GscQ02591 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GscQ02591 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GscQ02591 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GscQ02591 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GscQ02591 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GscQ02591 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GscQ02591 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GscQ02591 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GscQ02591 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GscQ02591 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GscQ02591 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GscQ02591 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GscQ02591 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GscQ02591 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GscQ02591 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GscQ02591 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GscQ02591 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GscQ02591 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GscQ02591 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GscQ02591 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GscQ02591 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GscQ02591 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GscQ02591 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GscQ02591 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GscQ02591 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GscQ02591 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GscQ02591 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GscQ02591 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GscQ02591 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GscQ02591 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GscQ02591 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GscQ02591 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GscQ02591 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GscQ02591 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GscQ02591 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GscQ02591 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GscQ02591 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GscQ02591 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GscQ02591 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GscQ02591 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GscQ02591 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GscQ02591 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GscQ02591 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GscQ02591 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GscQ02591 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GscQ02591 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GscQ02591 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GscQ02591 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GscQ02591 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GscQ02591 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GscQ02591 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GscQ02591 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GscQ02591 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GscQ02591 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GscQ02591 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GscQ02591 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GscQ02591 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GscQ02591 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GscQ02591 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GscQ02591 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GscQ02591 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GscQ02591 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GscQ02591 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GscQ02591 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GscQ02591 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GscQ02591 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GscQ02591 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GscQ02591 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GscQ02591 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GscQ02591 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GscQ02591 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GscQ02591 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GscQ02591 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GscQ02591 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GscQ02591 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms