Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ascl1Q02067 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms