Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VcpQ01853 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VcpQ01853 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VcpQ01853 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VcpQ01853 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VcpQ01853 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VcpQ01853 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VcpQ01853 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VcpQ01853 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VcpQ01853 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VcpQ01853 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VcpQ01853 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VcpQ01853 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VcpQ01853 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VcpQ01853 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VcpQ01853 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms