Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd1Q01822 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd1Q01822 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms