Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nme2Q01768 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms