Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HmgcrQ01237 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HmgcrQ01237 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms