Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrcdQ00LT2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms