Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gjb2Q00977 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gjb2Q00977 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gjb2Q00977 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gjb2Q00977 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gjb2Q00977 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Gjb2Q00977 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gjb2Q00977 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gjb2Q00977 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms