Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HmmrQ00547 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HmmrQ00547 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms