Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GabpaQ00422 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GabpaQ00422 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GabpaQ00422 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms