Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou1f1Q00286 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou1f1Q00286 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms