Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cds1P98191 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cds1P98191 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cds1P98191 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cds1P98191 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cds1P98191 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cds1P98191 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cds1P98191 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cds1P98191 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cds1P98191 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms