Protein–RNA interactions for Protein: P97817

Cdr2, Cerebellar degeneration-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2P97817 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdr2P97817 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr2P97817 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr2P97817 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms