Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarcc1P97496 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarcc1P97496 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarcc1P97496 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarcc1P97496 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarcc1P97496 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarcc1P97496 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarcc1P97496 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarcc1P97496 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarcc1P97496 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarcc1P97496 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarcc1P97496 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarcc1P97496 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarcc1P97496 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Smarcc1P97496 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarcc1P97496 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Smarcc1P97496 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Smarcc1P97496 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarcc1P97496 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms