Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npas2P97460 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npas2P97460 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Npas2P97460 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npas2P97460 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npas2P97460 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Npas2P97460 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npas2P97460 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npas2P97460 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npas2P97460 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Npas2P97460 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npas2P97460 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npas2P97460 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npas2P97460 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npas2P97460 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npas2P97460 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npas2P97460 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms